Flowy pokladňa je jednoduchá pokladničná aplikácia určená pre používateľov systému Flowy. Podporuje Slovenskú ekasu, skenery a váhoskenery, zákaznícky displej, prepojenie s platobným terminálom, viac pokladníkov, čítanie kupónov z automatov vrátnych obalov, vernostné a zľavové systémy, funguje aj bez internetu. Samozrejmosťou je podpora rôznych druhov platieb (hotovosť, platobná karta a stravné lístky), ako aj zaokrúhľovanie hotovosti. Pokladňa sa pripája na cloudový systém Flowy, čiže ceny viete upravovať odkiaľkoľvek, ako aj sledovať tržbu, najpredávanejšie položky, alebo jednotlivé bločky.